@Tiki, если без иерархии, то article_id и user_id в качестве внешних ключей достаточно. Далее собственный id, контент и время создания. Может, еще флаг премодерации. --- Добавлено --- На наших сайтах, если не учитывать кое-где оптимизацию для оч. большого числа комментов на один материал, это устроено именно так.
Есть два основных способа: Метод "Сущность - связь" Метод "Нормальных форм" В обоих случаях не мешает, для начала проектирования таблиц, определиться с набором данных, которые собираетесь хранить в БД.