ну тебе на это и намекают. у тебя подключение к серверу по хосту kvs.mysql - этот хост нужно отрезолвить еще в айпишник ибо подключение в реале происходит по айпи, а не имени хоста. и вот на этом варианте похоже твой хостинг и лагает - gethostbyname с опросом резолвера затягивает (или резолвер затягивает с ответом) и всё это дело упирается в лимит времени на подключение клиента мускула к серверу мускула. да, это к хостеру и/или пробовать настроить клиент на бОльшее время ожидания соединения. но это боком выйдет поскольку будет больше запросов к вебсерверу, которые тупо встанут в очередь ожидания подключения к серверу базы данных. поэтому я бы с хостером пообщался. возможно можно заменить хост подключения на какой-нибудь айпишник.