По инструкциям хостинг-провайдера вроде удалось поменять версию PHP на более новую (можно что-то менять только командами из .htaccess и еще специального файла). Скрипт phpinfo.php показывает новую версию PHP. В программе putty.exe же дается ответ, что версия старая. Почему так, как еще определить?
По ssh может быть одна версия по умолчанию, её ты запускаешь так например php -v но если доступны и другие, то нужно у тех поддержки спросить как их запускать тебе дадут путь, например /opt/php56/bin/php -v
Там же где ты вводил php, ты же сам пишешь что через putty заходишь по SSH, вот в putty и пиши как зашёл на сервер. Только точный путь узнай у хостера. Например у тебя была команда на запуск скрипта: php /home/cli.php меняешь её на /opt/php56/bin/php /home/cli.php